About...Partenaires : Département LUSSI de TELECOM Bretagne. Station Biologique de Roscoff, OUEST-genopole®. Ce projet a bénéficié de financements dans le cadre du projet Genomer et de OUEST-genopole®. Il bénéficie actuellement du soutien financier de la région Bretagne (PRIR CapExBio). Résumé : Le projet Bioside, en cours au département LUSSI de TELECOM Bretagne, a pour objectif la production d’une plateforme facilitant l’usage et le partage des ressources bioinformatiques par les différents acteurs de la biologie. A l’heure actuelle, l’utilisation de ces ressources se heurte à des problèmes d’ordre informatique (dispersion des ressources), de traçabilité (conservation et organisation des workflows et de leurs résultats) et de sémantique (variété des formats de données, complexité des paramétrages des programmes, complexité des modèles mathémtiques sous-jacents, etc.). La plateforme développée dans le cadre du projet Bioside permet d'étudier et de proposer des réponses à l’ensemble de ces problèmes. Une première version opérationnelle du prototype est prévue en début d’année 2008. Elle facilite la conception, l’exécution et la gestion de chaîne de traitements bioinformatiques (scénarios) ; elle assure la transparence vis-à-vis des ressources bioinformatiques. A travers le projet CapExBio (PRIR Bretagne), le projet aborde désormais les problématiques de coopération entre les différents acteurs de la bioinformatique (biologistes, bioanalystes, bioinformaticiens, administrateurs de ressources informatiques). Ce projet doit permettre de proposer des solutions aux difficultés rencontrées par ces acteurs à capitaliser leurs connaissances sur l'utilisation des ressources bioinformatiques. A travers le projet BioWorkflow (projet ReNaBi : Réseau National de Bioinformatique), l'équipe participe à l'évaluation des approches de fédération fondé sur les web services. Contact ENSTB Philippe Picouet (Philippe.Picouet@telecom-bretagne.eu)
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